Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab11fip3Q8CHD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab11fip3Q8CHD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab11fip3Q8CHD8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rab11fip3Q8CHD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rab11fip3Q8CHD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms