Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8CD60 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8CD60 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8CD60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8CD60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8CD60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8CD60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8CD60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8CD60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8CD60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CD60 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CD60 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CD60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CD60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CD60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CD60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CD60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CD60 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CD60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CD60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CD60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CD60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CD60 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8CD60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8CD60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8CD60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8CD60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CD60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CD60 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CD60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CD60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CD60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CD60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CD60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8CD60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8CD60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8CD60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CD60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CD60 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CD60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CD60 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CD60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CD60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CD60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CD60 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CD60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8CD60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CD60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CD60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CD60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CD60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CD60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CD60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CD60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CD60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CD60 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CD60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CD60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CD60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CD60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms