Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc60Q8C4J0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc60Q8C4J0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc60Q8C4J0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms