Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4H2

Samd3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd3Q8C4H2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samd3Q8C4H2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd3Q8C4H2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd3Q8C4H2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd3Q8C4H2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms