Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms