Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr33Q8C494 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr33Q8C494 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr33Q8C494 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr33Q8C494 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms