Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TiparpQ8C1B2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TiparpQ8C1B2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TiparpQ8C1B2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms