Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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Nek11Q8C0Q4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nek11Q8C0Q4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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Nek11Q8C0Q4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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Nek11Q8C0Q4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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Nek11Q8C0Q4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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Nek11Q8C0Q4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nek11Q8C0Q4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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Nek11Q8C0Q4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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Nek11Q8C0Q4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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Nek11Q8C0Q4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek11Q8C0Q4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
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