Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim35Q8C006 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim35Q8C006 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms