Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc169Q8BXX9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc169Q8BXX9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc169Q8BXX9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms