Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trerf1Q8BXJ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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