Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms