Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod1Q8BVA4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod1Q8BVA4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lmod1Q8BVA4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lmod1Q8BVA4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms