Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV8

A530064D06Rik, Plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530064D06RikQ8BNV8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A530064D06RikQ8BNV8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A530064D06RikQ8BNV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A530064D06RikQ8BNV8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms