Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms