Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpa1Q8BLA8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpa1Q8BLA8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpa1Q8BLA8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpa1Q8BLA8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpa1Q8BLA8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpa1Q8BLA8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpa1Q8BLA8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms