Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJM7

Tyw1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw1Q8BJM7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tyw1Q8BJM7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tyw1Q8BJM7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tyw1Q8BJM7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms