Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prune1Q8BIW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prune1Q8BIW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prune1Q8BIW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prune1Q8BIW1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prune1Q8BIW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prune1Q8BIW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prune1Q8BIW1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prune1Q8BIW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms