Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srgap3Q812A2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Srgap3Q812A2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Srgap3Q812A2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Srgap3Q812A2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms