Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5bQ80Y84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5bQ80Y84 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5bQ80Y84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5bQ80Y84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5bQ80Y84 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm5bQ80Y84 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Kdm5bQ80Y84 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.2 ms