Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dsg1cQ7TSF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg1cQ7TSF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms