Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek5Q7TSC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek5Q7TSC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek5Q7TSC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek5Q7TSC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms