Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf139Q7TMV1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf139Q7TMV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf139Q7TMV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms