Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam107aQ78TU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam107aQ78TU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam107aQ78TU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms