Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mindy1Q76LS9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mindy1Q76LS9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mindy1Q76LS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mindy1Q76LS9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms