Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rph3alQ768S4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rph3alQ768S4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.1 ms