Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spcs3Q6ZWQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spcs3Q6ZWQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spcs3Q6ZWQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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