Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms