Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ncapd3Q6ZQK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd3Q6ZQK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms