Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp34Q6ZQ93 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp34Q6ZQ93 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp34Q6ZQ93 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp34Q6ZQ93 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms