Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc88cQ6VGS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms