Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Casc1Q6TDU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casc1Q6TDU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casc1Q6TDU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms