Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcaf3Q6QR59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf3Q6QR59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf3Q6QR59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf3Q6QR59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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