Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt3Q6PE13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrt3Q6PE13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrt3Q6PE13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms