Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2d40Q6P8N9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2d40Q6P8N9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms