Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RbfaQ6P3B9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RbfaQ6P3B9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RbfaQ6P3B9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RbfaQ6P3B9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RbfaQ6P3B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms