Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm2bQ6P1G2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm2bQ6P1G2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm2bQ6P1G2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm2bQ6P1G2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm2bQ6P1G2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms