Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad17Q6NXW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rad17Q6NXW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rad17Q6NXW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad17Q6NXW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad17Q6NXW6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms