Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt2Q6NVG7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Colgalt2Q6NVG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Colgalt2Q6NVG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Colgalt2Q6NVG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms