Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd2Q6DVA0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lemd2Q6DVA0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms