Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc3c1Q6DFV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms