Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ric1Q69ZJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ric1Q69ZJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ric1Q69ZJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ric1Q69ZJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms