Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sptbn2Q68FG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sptbn2Q68FG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sptbn2Q68FG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms