Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Knl1Q66JQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Knl1Q66JQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Knl1Q66JQ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Knl1Q66JQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Knl1Q66JQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Knl1Q66JQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms