Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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Clcn1Q64347 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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Clcn1Q64347 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clcn1Q64347 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
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Clcn1Q64347 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clcn1Q64347 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clcn1Q64347 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clcn1Q64347 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clcn1Q64347 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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Clcn1Q64347 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Clcn1Q64347 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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Clcn1Q64347 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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Clcn1Q64347 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clcn1Q64347 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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Clcn1Q64347 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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Clcn1Q64347 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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Clcn1Q64347 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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Clcn1Q64347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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Clcn1Q64347 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
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Clcn1Q64347 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clcn1Q64347 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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Clcn1Q64347 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn1Q64347 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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