Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScxQ64124 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ScxQ64124 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScxQ64124 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScxQ64124 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScxQ64124 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ScxQ64124 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScxQ64124 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScxQ64124 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScxQ64124 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScxQ64124 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScxQ64124 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScxQ64124 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScxQ64124 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms