Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pan3Q640Q5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pan3Q640Q5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pan3Q640Q5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pan3Q640Q5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pan3Q640Q5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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