Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall3Q62255 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sall3Q62255 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall3Q62255 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sall3Q62255 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall3Q62255 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sall3Q62255 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms