Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a2Q62203 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a2Q62203 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a2Q62203 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms