Protein–RNA interactions for Protein: Q61527

Erbb4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb4Q61527 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Erbb4Q61527 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Erbb4Q61527 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erbb4Q61527 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erbb4Q61527 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erbb4Q61527 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms