Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc6Q61143 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc6Q61143 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc6Q61143 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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